一日，已经由宫中助理升任第巴的桑结正与五世达赖议事，益西总管忽然进屋说有要事禀报。五世示意他快讲，益西这才说：“佛爷，第巴大人，阿里活佛大闹经堂，刚才被格贵大喇嘛手下执事押送第巴府处置，意外死……”
益西总管的话还没说完，桑结顿觉佛爷身体有些站立不稳，忙上前搀扶：“佛爷身体不舒服？”
“我没事，是布达拉宫在晃动啊。”见桑结和侍从们惊慌地四处察看，五世达赖又语重心长地说，“佛家讲‘境由心生’，心宁雪域才能安，我感觉到人心的晃动了。”
哲蚌寺密宗院成立后，五世达赖为贯彻“教派平等，互相请益”的方针，特延请各个教派高僧授课，阿里活佛正是在这种情况下进入哲蚌寺的。这位活佛是个秉性直、有学问的高僧，只是脾气急躁些。一次讲课中，活佛对“教派平等，互相请益”的方针表现出了一些误解，他认为这是要取消各宗，搞“教派混合”，由此引发了与学生之间的激烈争执。第二天早上，他路过经堂时，看见众僧正在作晨祷，活佛余气未消，又提起昨天的话茬，自然导致争吵，活佛情绪失控，影响了经堂，甚至多有对五世达赖的不敬之词。
搅乱经堂，在教法中是一桩大罪，格贵大喇嘛于是下令将阿里活佛送至第巴府处置。一路上，活佛仍不停地呼叫，引来众多路人围观。阿里活佛到第巴府中后仍不住口，押送的喇嘛气急之下用一条哈达向其口中塞去，不想用力过猛，竟致其窒息而亡。
经商议，桑结立即布置了善后事宜，派员赶赴活佛本寺阿里托林寺，解释情况并致歉；将活佛法体暂移色拉寺，待托林寺来人，共商法体处置事宜。然而，事态的演进出乎预料：先是几座已变帽归黄的寺庙擅自改回，并驱逐了寺内原格鲁僧人；派驻楚布寺的官员也因受到威胁被迫退出；接着传来后藏有的教派联手世俗势力起兵攻打地方政府、赶走或杀害地方官员的消息。一时间，拉萨城里谣言纷纷，人心惶惶。
在这敏感、关键的时刻，哲蚌寺以格贵大喇嘛为首的部分僧人，将形势的动荡，归罪于活佛灵魂的搅动，竟听信不知谁人所言，欲施“锁魂术”，以平息事态。消息传到宫里，五世达赖震惊了，立命桑结嘉措速速赶往哲蚌阻止。桑结深感事态严重，设若无力阻止，后果不堪设想，可哲蚌寺诸僧非师即友，自已担任第巴才二年多，能压住阵吗？
“学生这就前去，还请佛爷立颁法旨，方保无虞。”
五世达赖点点头，像是自言自语地说：“看来‘护摩火祭’要尽早举办了。”
“护摩火祭”是藏密的一项重要法事，它认为“断缘”之人，轮回被迫中断，其灵魂余业尚未尽消，势必影响进入下一轮回，大多游荡世间骚扰他人。故火祭之意是以智慧之火助其焚烧贪、嗔、痴诸般烦恼，使灵魂解脱得以进入轮回，趋向善道。而“锁魂术”则是针对尚未皈依佛法的妖魔，拘押其魂魄，不使危害众生，此为藏密之厉法，极少使用。
桑结与侍从纵马赶到时，寺前广场已是黑压压一片人，当中立一木架旁边放有绳索、木枷、脚镣、手铐等物。
“第巴大人到！”听到侍从宣呼，人们安静下来。
桑结一眼看到格贵喇嘛正在摆放各种法器，直奔过去加以劝阻。格贵曾给桑结上过戒律课，此时一副冷漠的样子：“大人，第巴府干预寺庙法事，可曾有此规定？”
“师父，阿里活佛身份不同一般僧人，如何处置事关重大，务请撤除，议后再动。”
“他搅乱经堂不算，魂儿还四处煽动，搅得本寺不得安宁。不镇伏，怕是你这个第巴也坐不长啊。”
这时但见捉魂旗摇动，催命鼓敲响，数百僧人排成做法阵型。桑结见劝阻无效，与两名侍从成三角形，护住那根用来捆绑鬼魂的木架。正在对峙，只见宫中特使诺尔布快马赶到，身后三名执事，一名撑开宝伞，二名呜呜地吹起腿骨法号，随着一声“宣读佛爷法旨”，顿时全场肃静。
法旨中对这一草率行为加以严辞切责：“……搅乱经堂，有违教法，固当责罚。然细察缘由，系因教派之见引发，情有可原。大师力倡诸宗平等，尔等如此小器，宽容之心何在？同为佛门中人，偶犯过失即欲施毒法，谈何慈悲为怀？旨到立撤，不从者，铁棒逐出寺门。着该寺代理池巴、总管及各处堪布听命，自今起，全寺封门百日，驱魔除障，切实自省。明年祈愿大法会，该寺僧众不得报名参加格西考试。以上各项，由第巴府派员监督。”
处罚之重，连桑结嘉措也感意外。
但事态还在蔓延扩大。后藏土豪松热林和追随噶玛受到处罚的贵族哲右坚赞，在土匪噶茶的协助下分别攻入宗政府所在地南木林和仁本，自封宗本，发号施令，四出侵扰。在前藏工布地区，变帽和谴散的原噶玛僧人纠集密谋，在一个深夜，将当地着名黄教曾吉寺纵火焚毁，烧死五百余名喇嘛，寺内经文法器、佛像珍宝化为灰烬。布达拉宫和大小昭寺连续七日七夜做法事以超度亡灵。拉萨城里出现了许多外地僧人，有的结成松散的小队在街上大声呼喊，除了反对所谓的“格鲁兼并，取消教派”外，还有人喊叫“四宗合治，共推第巴，”等等。
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