988年，感于自己大限将至，陈抟安排弟子贾德升去莲花峰下的张超谷开凿一个山洞，说我要去那休息休息了。
第二年山洞凿出来以后，七月二十二日陈抟便在洞中坐化了，七天后肉身还有温度，五色云雾蔽塞洞口，经月都没有散去。
对于陈抟的一生，很多人有过总结，感觉其中最为恰当的无过于洛阳龙门石窟的一副石刻对联：
开张天岸马，奇逸人中龙。
相传这副对联是陈抟结束了武当山的二十年修行出关时所刻，很多人称它是中国第一联。不过也有人考证说对联的确是陈抟写的，不过并不是他刻上去的，这副字一直在民间流传，最近的记载是康有为重金从民间求得，结果张大千的老师李梅庵听说后就给借走了，直到死后才舍得归还。此后，据说这幅字又到了张大千的另一位老师曾农髯的手中，再以后就流失到了海外，希望没有毁于战火，哪一天能够重现天日吧。所以，龙门石窟的那幅对联很可能是明代时，有人按这副字仿刻上去的。
再引用朱熹在《寄陆子静书》中说的一句话：“熹衰病，幸叨祠禄，遂为希夷直下诸孙，良以自庆”，这是儒家对他的肯定。
陈抟的着述还是很多的，在《宋史》中，记载了陈抟的比较重要的作品，包括：《宋史·艺文志·易类》记录他作有《易龙图》一卷，《宋史·艺文志·神仙类》记录《九室指玄篇》一卷，《宋史·艺文志·五行类》记录《人伦风鉴》一卷，《宋史·艺文志·别集类》记录《钓潭集》二卷，《宋史·陈抟传》记录有《指玄篇》八十一章、《三峰寓言》五十首、《高阳集》一卷和诗六百余首。《九室指玄篇》和《指玄篇》是一部书，还有一些没有列举出来，可见陈抟的着述相当丰富，只是可惜大多数都佚失了。
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