暗影侵蚀者被彻底消灭后，联盟宇宙进入了战后重建与探索阶段。极寒宇宙的沦陷行星在净化能量与海洋能量、植物能量的共同滋养下，逐渐恢复了往日的生机；联合防御部队补充了新鲜血液，新的防御技术与武器不断涌现；跨宇宙监测网络也进行了全面升级，能够更精准地捕捉未知区域的能量信号。
明轩将从暗影领主身上收缴的三枚暗影晶体带回多元核心，进行深入研究。这三枚晶体分别蕴含着蚀影、幽影、幻影的核心能量，虽然暗影侵蚀能量已经被大部分净化，但仍残留着一丝本源气息，以及一些碎片化的意识信息。
辰宇的科研团队与来自各个宇宙的专家们，利用多元星核的能量，对暗影晶体进行了解析。经过半个月的努力，他们成功提取出晶体中的意识碎片，并还原了部分信息。
在联盟最高议会的会议上，辰宇展示了还原后的信息画面：“根据暗影晶体中的意识碎片，我们发现暗影侵蚀者并非自然形成的种族，而是被‘暗影本源’创造出来的工具。暗影本源是一种存在于宇宙诞生之初的原始黑暗能量，它的目标是吞噬所有宇宙的本源能量，将整个星空转化为纯粹的暗影世界。”
“暗影本源？”绿茵宇宙的代表眼中闪过一丝震惊，“我们的古老传说中，也提到过这种原始黑暗能量，它与光明本源是宇宙诞生之初的两种对立能量，共同维持着宇宙的初始平衡。但后来光明本源消散，暗影本源也沉寂了下去，没想到它竟然还存在。”
深蓝宇宙的代表补充道：“我们的海洋文明也有类似的记载。传说中，光明本源与暗影本源碰撞后，产生了宇宙大爆炸，才有了各个平行宇宙的诞生。光明本源的能量分散到各个宇宙，成为了宇宙的本源能量；而暗影本源则潜伏在星空深处，等待着复苏的机会。”
明轩的眼中闪过一丝思索：“这么说来，我们之前遇到的域外族群、暗影寒族，甚至是原始星灵，都可能与暗影本源有关？它们都是暗影本源用来吞噬宇宙能量的工具？”
夜痕点了点头，暗影符文闪烁着紫色光芒：“暗影晶体中的意识碎片显示，暗影寒族是暗影本源早期侵蚀极寒宇宙能量后，创造出的第一个族群。后来暗影寒族被封印，暗影本源又在其他星域创造了暗影侵蚀者，继续执行吞噬计划。而域外族群和原始星灵，则是受到暗影本源的影响，才变得贪婪、好战，试图吞噬其他宇宙的能量。”
“如果暗影本源真的存在，那它的实力将难以想象。”冰岚的脸色凝重，“暗影侵蚀者只是它的工具，就拥有如此强大的实力，要是暗影本源亲自出手，我们根本没有任何胜算。”
“大家不用过于悲观。”灵汐说道，幻梦符文泛起七彩光芒，“暗影晶体中的信息还显示，暗影本源虽然强大，但它的复苏需要吞噬大量的宇宙本源能量。目前它还处于沉睡状态，暗影侵蚀者的失败，让它损失了大量能量，短期内无法再发起大规模攻击。而且，光明本源虽然消散，但它的能量分散在各个宇宙中，多元星核就是光明本源能量的集中体现，我们可以利用光明本源的能量，克制暗影本源。”
明轩点了点头，眼中闪过一丝坚定：“灵汐说得对。暗影本源是我们共同的敌人，但只要我们团结一心，利用光明本源的能量，提前做好准备，就一定能够抵御它的威胁。现在，我们需要制定长期的应对计划。”
经过最高议会的讨论，最终确定了三项核心计划：
第一，启动“光明本源唤醒计划”。由多元星核为核心，联合各个宇宙的能量核心，构建起覆盖所有联盟宇宙的光明能量网络，不断汇聚、唤醒分散在各个宇宙中的光明本源能量，提升联盟的净化与防御能力。
第二，实施“跨宇宙探索深化计划”。组建多支探索舰队，深入未知星域，寻找暗影本源的具体位置，收集更多关于暗影本源的情报，同时寻找其他可能存在的友好宇宙，扩大联盟规模，增强对抗暗影本源的力量。
第三，开展“联盟实力提升计划”。整合各个宇宙的资源与科技，研发更强大的净化武器与防御设备；加强跨宇宙守护者的训练，提升个体实力与协同作战能力；建立联盟后备力量储备体系，确保在未来的战争中，有足够的兵力应对威胁。
计划启动后，联盟各个宇宙立刻行动起来。光明本源唤醒计划进展顺利，多元星核与各个宇宙能量核心的共鸣越来越强烈，光明能量网络逐渐成型，联盟宇宙的净化能量浓度不断提升，甚至对暗影能量产生了天然的排斥力。
跨宇宙探索深化计划也取得了显着成效。三支探索舰队分别朝着不同的未知星域出发，其中一支舰队在距离联盟宇宙百万光年的地方，发现了一个以科技与魔法结合为核心的文明——“星辉宇宙”。星辉宇宙的文明高度发达，拥有强大的魔法能量与先进的科技武器，而且他们的魔法能量中，蕴含着浓郁的光明本源气息，与联盟的能量体系高度契合。
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