陆上的战斗顶住了杨捷的攻势，蒋一正腾出手来继续发动水面上的攻势，派遣郑军舰队向崇明岛江边的清军水师发起进攻。清军水师的船已经不足五十只，而且多是二、三等的小船，稍一接战便沉了十多艘，其余向长江上游逃脱，又有几艘船向郑军投降。
可惜，蒋一正现在没有足够的兵力登上崇明岛作战。崇明岛作为清军的海防要冲，防御工事建设得相当完善，尤其是崇明县城，当年郑成功以优势兵力也未能攻下。不过既然歼灭了清军水师，吴淞口的郑军就再无后顾之忧，可以安心与杨捷一较高下。
杨捷显然只能按兵不动，因为进攻乏术，唯一的选择就是等待江宁方面的支援。项绍宽的军报再一次转了一大圈，送到了蒋一正的手里，内容则是喜忧参半：郑军连续攻打海盐县城，城中清军顽强抵抗，暂时未能攻克，城外的拉哈达依然不敢轻易交战。吕宪华所部因为难以抵挡清军纪尔他布所部八旗兵的进攻，已经弃营撤退，并且报告何九与金国兰阵亡，天台镇三营郑军只有五百余人退守桐乡县。
蒋一正和许纬辰对这个结果都感到惊讶，毕竟这是登陆作战以来第一个重大挫折，也是首次单场战斗伤亡上千。但林升却觉得没什么大不了，不单是胜败乃兵家常事，而且天台镇是以绍兴收编的义军为主，战斗力本来就不强，打胜仗还好，打了败仗自然会溃散，真实的伤亡未必有那么多，事后收拢一下，或许还能找回来几百人。
至于战场形势，三个人倒是一致认为，决定性的问题是何时能攻克海盐县城。纪尔他布获胜之后，必然进军嘉兴，与喇哈会合，然后猛攻岛津久治的日军，以日军以往的表现来说，能撑多久不容乐观，一旦清军获胜，就会继续向海盐方向进兵，到时候再与拉哈达合兵一处，那郑军再要攻取海盐就非常困难了。
遗憾的是，蒋一正并没有任何办法为项绍宽和刘国轩支招，也无法提供帮助，现在唯一能做的就是牵制住杨捷的兵力，不让他南下增援。吴淞口这里僵持不动，海盐县城又攻而不克，浙北苏南战场就成了一个死局。
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