干王回天京后，把和吴天佑讨论换地的事情奏报给洪秀全。洪秀全闻后大喜，立即遣人和李秀成商量。当李秀成听到是以湖州、嘉兴两府换地时，愉快的答应了。
至此，1861年元月1日，三方执行换地计划，中枢接管镇江、常州两府，忠王接管湖州、嘉兴，吴天佑则接管绍兴、宁波、台州三府。并派兵搜缴了镇妖军的所有钱粮，由扬威军第五师和三个骑兵旅“护送”他们出扬威军控制区。
镇妖军行至杭州，将士们为杭州的花花世界所吸引，强烈要求进城放松，被署理军帅蒙时雍拒绝。并强烈警告镇妖军将士，不得出军营半步。
可放荡惯了的将士，总有几个被猪油蒙了心的不怕死的家伙。一卒长入夜后，带着亲兵溜出军营，就往杭州城方向走。刚走1里地就被扬威军哨兵拦住去路，勒令他们立即返回军营，否则格杀勿论。
兴冲冲准备去寻欢作乐的卒长、亲兵们自然满心不乐意，便上前与哨兵理论。哨兵什长任由镇妖军将士说话，却一句不回答。只是做了个手势，后面的扬威军士兵便举起步枪，直至镇妖军卒长他们。
卒长看情形不对，知道硬闯不行，就骂骂咧咧地带着亲兵往回走。扬威军哨兵什长轻蔑一笑，吐出两个字：开火。
至此以后，就再没有哪个镇妖军将士敢踏出军营半步。
1860年（清咸丰十年）夏，正当太平军二破江南大营和东征苏、常之际，两江总督、钦差大臣曾国藩和湖北巡抚胡林翼乘机统率湘军水陆师6万余人，自湖北大举东犯。连陷安徽太湖、潜山后，即以夺取安庆为目标。
命曾国荃率领陆师8000人会同水师4000人，担任围城任务；命副都统多隆阿、按察使李续宜率马步2万，驻扎桐城西南挂车河、青草塥，担任打援任务。6月20日，湘军水师攻陷安庆要地枞阳后，完成对安庆合围。
曾国荃在安庆城城外掘长壕两道，前壕围城，后壕拒援。
安庆自1853年为太平军占领后，一直就是天京（今南京）西线屏障和粮源要地。这时由受天安叶芸来、谢天福张朝爵率万余人驻守待援。
咸丰十年八月，洪秀全从各地调集兵力，分四路由大江南北西进，救援安庆。命令陈玉成率军走长江北岸，从安徽直入湖北，攻武昌北路；李秀成率所部经江西直下湖南岳州，绕出武昌之西；李世贤率所部由江西入湖北，攻武昌南路；杨辅清部经江西湖口、九江入湖北，攻武昌东路。要求各路人马于半年后会师武昌。
忠王李秀成及侍王李世贤，由于刚刚占领苏常一带，民心尚未稳定。而将士们长期征战，疲惫不堪，亟待修整。加之这次是在膏腴之地征战，忠殿军从上到下收获颇丰，迫切需要一段时间来消化胜利果实。
全军上下都不想出征，这其中就包括忠王李秀成。对于天王要求忠殿军西进江西攻打湖南岳州的命令，忠王很是无奈。最后，众人协商之下，遣使上书天王要求缓期西征，待苏常一带趋于稳定后，再行西进。
而陈玉成接到天王旨意后，率军从天京渡江西进，欲解安庆之围。鉴于兵力不足，陈玉成于八月二十五日进入皖北捻军驻地，与龚得树、孙葵星等部会合，兵力增至十余万人。
十月，陈玉成携捻军挺进挂车河，进攻围困安庆的清军，遭到多隆阿、李续宜部的激烈抵抗，攻势受阻，遂退驻桐城休整。
十二月，陈玉成率军向南攻击枞阳清军，也是无功而返。退回桐城再次休整。
虽然已经临近年关，桐城内外依然没有多少过年的气氛，战争给桐城带来了严重的创伤。太平天国的军纪虽然不怎么样，但这毕竟是自己的统治区域，多少有些顾忌。而南下的捻军本来就带有浓烈的绿林气息，军纪奇差不说，由于是客军更是肆无忌惮，经常发生打砸抢事件。太平军鉴于是友军，又不便出手处理。弄得桐城一带民众是天怒人怨，苦不堪言。
入冬后的气温越来越冷，迫使交战双方都放慢了战斗的节奏，甚至暂停交战。这对于连战连败的太平军而言，是难得的休整机会，将士们的心渐渐稳定，士气开始慢慢恢复。
与此同时，在池州府东流县的湘军大营里，曾国藩正和李鸿章、左宗棠一起，谈论安庆战况。此时，曾国藩已经是两江总督，总览江苏、安徽、江西三省军政大权，妥妥的实权人物。已经不是湖北巡抚胡林翼所能抗衡的了。
在樊燮京控案中险些丧命的左宗棠以四品京堂候补，随同钦差大臣、两江总督曾国藩襄办军务，正式进入了湘军系列。其实，左宗棠这份职务就是曾国藩举荐的。
曾国藩虽然对左宗棠的处事方法很不屑，却一直很看重左宗棠的军事才能。擢升两江总督后，曾国藩深感仅凭一直湘军，很难撼动发匪。决意开辟第二战场，多方位攻击太平天国。左宗棠就是他预备的一方大员。
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