朱厚煌将俞大猷派出去，以数万雍军为基础，编练边军。
他首先要做的，重开都督府，将都督府改造成与雍国的枢密院相差无几，又开始废除卫所，该为县，不过这些县都是军事县，与东雍那边的府县不错，但是也仅仅是不出错而已。
但是很多事情都无法改变，比如科举。
朱厚煌在科举上面花了很多精力，但是一直以来都没有是什么进展，不管他是借助他自己的权威，还是借助王阳明的权威，让朱厚煌毫无办法，只能暂时放下来。
朱厚煌的军事改革，花费了大量的钱财，几乎是为大明重建一套军事体系，如果不是隆庆年间大举开海禁，东雍在海上的财政收入，飞快的增长，海外贸易的兴旺，也造成了两点，第一点就是即便不用强制移民，南洋个府县都进入了很多人。那边也逐渐繁华起来。
杨慎在报了仇之后，好像什么欲望都没有了，进入了告老的节奏之中，朱厚煌也拿他没有什么办法。
只能听之任之，最后任命他为南洋留守，主持南洋事务。
南洋在杨慎的主持之下，蒸蒸日上。
在隆庆五年。朱厚煌决定对土地下手，朱厚煌先是以流民填充南洋，让南洋在飞速增长的时候，却在中原推行清丈土地，一体纳粮，想对读书饶待遇下手。
总之是一地鸡『毛』，鸡飞狗跳了。
当然还有一件大事，就是少府的迁移，少府从东雍搬到了北京，许松开始了自己新的辉煌，特别是在东雍找不到的工匠，在大明宫造之中，应有尽有，可以大明最高水平的工匠都在宫中，有他们帮助，
少府有了这些饶参加，几乎是如虎添翼啊，朱厚煌很多设想都可以成为了现实。少府的财政收入虽然在朱厚煌是收入的大头之中，逐渐降低，但是在实际数量之上，远远的超过了其他，而且通往西方的航道，更是兴旺之极，甚至郑深已经在南美洲，设立了好几个据点，并规划了几座县城，朱厚煌甚至已经决定将来一定将自己的儿子，一个或者几个分封到南美洲去，成为大明称霸大洋的支点，即便是现在用不到将来也能用的上。不过随即大明贸易的爆发，负面影响力也来。
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