历史上明末海军主要指郑芝龙麾下庞大水师，而此时明朝在朱慈烺的调整下，水师并不止郑芝龙一支。
郑森从郑芝龙军中独立出来，皮岛沈世魁也有百艘大小战舰和商船，登莱总金日观麾下也有近百艘战船，还有施琅和黄蜚两支水师。
郑森麾下有大型战船近百艘，基本都是郑芝龙舰队的主力战舰，现在又加入八艘大型战舰，实力肯定暴涨。
施琅率领的麾下有战舰三十艘，运兵船等加起来达到八十艘左右，黄蜚麾下水师战舰和施琅舰队规模差不多。
不过这次施琅舰队又增加六艘大型战舰，实力已经超出黄蜚一大截。
由于生产力问题，黄蜚他们这支舰队想要增加新的大型战舰，至少要等到年底才行。
除此之外，舟山和广东都有水师，主要是一些卫所，由于常年没有新船下水，只能依赖那些较小战船，称为巡逻船更加合适。
以后大明舰队作战，肯定要靠四大舰队，现在这些小型水师到时将全部变成巡逻船，放开海禁后，他们要保障前来大明交易和出口贸易的商船。
英国佬这次入侵大明，好像几个月后才离开，朱慈烺知道不用太着急，郑森他们有足够时间赶到事发地！
郑森已经是大明侯爵，又是现在大明海军最高长官，此事全权交给郑森去处置即可，他相信郑森会做的很好。
而他还有其他事情要做，土地改革要全面展开，为此，朱慈烺要亲自前往南京坐镇。
神武二年六月三日，朱慈烺端坐在皇极殿龙椅之上，今日这个朝会可能是他今年最后一次，因为第二日他将率军南下。
朝堂上新任内阁已经到齐，他们分别是内阁首辅孙传庭，内阁次辅卢象升，阁臣冯英，杨廷麟，李岩。
还有一个内阁阁臣洪承畴，暂时不在京师，他正在山东进行土地改革，只有完美完成山东土地改革，洪承畴才能回朝。
六部尚书除了刑部尚书冯英外，基本上都换了新人，吏部尚书有孙传庭兼任，户部尚书左懋庚，工部尚书陈子龙，礼部尚书杨廷麟兼任，兵部尚书卢象升兼任。
五军都督府左都督现在是英国公张世泽，右都督有秦国公孙应元担任，海军都督为朱成功。
现在大明除五军都督府和兵部外，还成立一个最具权威的机构，那就是大明军机部，神武皇帝朱慈烺担任军机部部长，成员有孙传庭，卢象升，黄德功，孙应元，周遇吉，曹变蛟，朱成功七人。
五军都督府负责练兵，兵部主要负责调兵和后勤保障，军机部统筹全局并负责指挥战斗。
大型战斗调兵必须通过军机部，神武皇帝朱慈烺可以随意调动所有军队，朱慈烺不在的情况下，调兵需要经过军机部多数人同意才能通过。
除特殊情况外，超过万人的兵力调动，都必须通过神武皇帝和军机部同意，不然任何人不得私自调兵。
除此之外，新成立海军部和三大舰队，海军大都督乃是神武皇帝朱慈烺，海军都督朱成功。
南海舰队有海军都督朱成功亲自担任，施琅担任东海舰队副都督，北海舰队副都督为黄蜚。
另外还成立近海舰队，近海舰队主要负责近海巡逻和海上治安，近海舰队都督为金日观，两个副都督为沈世魁和郑鸿逵。
掌管长江水师的总督诚意伯刘孔昭能力有限，卸任抄江总督。把长江水师并入近海舰队，有近海舰队副都督郑鸿逵负责内河防御。
南明隆武帝朱聿键版图内，除了何腾蛟和瞿式耜，就得数到福建势力——郑芝龙。
郑芝龙固然是郑氏集团的首领，不过隆武帝被拥立，其实与郑芝龙并没有直接的关系。
当时郑芝龙盘踞福建，主要精力还是在自己的家族事业上，参与拥立朱聿键的，是郑家另一位大佬——郑鸿逵。
郑鸿逵是郑芝龙的亲弟弟，这点在名字上似乎看不出来，这是因为郑鸿逵是他进入官场后的名字，他的本名，叫做郑芝凤。
郑芝凤就是郑芝龙安插在官场的郑氏代言人，与大哥相比，他在集团内的业务，主要是负责官场的对接，于是他长期待在南京，并得到了个镇江总兵的官职。
弘光帝被俘，潞王朱常淓降清后，大家迫切需要再拿个皇帝出来。
这时郑氏在福建势力虽大，还远远没到可以一手操纵帝位的地步，于是众文武纷纷来到福建开会，商量帝位人选。
这个人选，可选之人其实已经不多，从血统上来说，唐王朱聿键已经是离太祖血脉较近的一个。
加上他在之前给总兵郑鸿逵，户部主事苏观生，右副都御史路振飞，礼部尚书黄道周等人的印象都不错，认为他是贤王，几位大佬一合计，就打算立朱聿键。
不过在立朱聿键这件事上，郑芝龙一开始就不热心。
朱聿键就任监国后，接下来就面临要不要称帝的问题，在这件事上，郑芝龙再次表明了他的态度，就是不想让唐王称帝。
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