因艾斯公开处刑，白胡子海贼团率旗下海贼团大战海军本部以及王下七武海，路飞，黑胡子海贼团，红发海贼团相继登场，此次大事件史称“顶上战争”，其结果海军胜利，波特卡斯·D·艾斯和爱德华·纽盖特战死。至此，新时代拉开帷幕。
蒙奇·D·路飞因参加顶上战争，悬赏金涨到四亿贝里。
顶上战争结束，世界政府指使唐吉诃德·
多弗朗明哥抹杀月光·莫利亚，但被阿布萨罗姆和霍古巴克一同救出，抹杀未遂。
蒙奇·D·路飞因为波特卡斯·D·艾斯牺牲而伤心欲绝，深知自身实力存在不足，决定拜西尔巴兹·雷利为师，暂停冒险，开始修行。并与伙伴约定两年后香波地群岛再集结。
萨博因得知波特卡斯·D·艾斯牺牲的报道，受到遗失的记忆冲击，痛苦万分的他跌倒在地，陷入昏迷状态，醒来之后，寻回了自己所有记忆。
战国辞去海军元帅职务，并举荐库赞为新任海军元帅。
108，1年前～海圆历1521年
赤犬萨卡斯基与青雉库赞为争夺海军元帅职位在庞克哈萨德大战十天十夜，双方都有负伤，最终萨卡斯基胜出成为了新海军元帅，库赞退出海军。
因顶上战争白胡子和艾斯牺牲，白胡子海贼团马尔科等人与黑胡子海贼团展开一场大战，最终以白胡子海贼团残党惨败告终，马尔科乔兹等人下落不明，之后黑胡子马歇尔·D·蒂奇一举成为了新四皇，并开始狩猎恶魔果实能力者，史称“了断之战”。
特拉法尔加·罗作为主谋策划了“洛基港口事件”，凭借夺取100名海贼的心脏，成为新任的王下七武海。
巴基被邀请成为新王下七武海。
因世界征兵，藤虎一生成为海军本部新任大将。
因世界征兵，绿牛成为海军本部新任大将。
爱德华·威布尔成为了新王下七武海。
因四皇爱德华·纽盖特的牺牲，鱼人岛转由四皇夏洛特·玲玲保护。
基德因挑战四皇红发香克斯而失去左臂。
109，现在～海圆历1522年
草帽海贼团再集结，向鱼人岛进发。
草帽海贼团登陆鱼人岛，时隔两年再次与甚平相见，结识人鱼公主白星，粉碎了霍迪·琼斯的阴谋并打败了新鱼人海贼团。鱼人岛拥有记载800年前乔伊波伊谢罪文的历史正文石碑，知道了人鱼公主白星是古代兵器海王的秘密。
夏莉预言蒙奇·D·路飞未来会毁灭鱼人岛。
麦哲伦正式将署长的职位交接给汉尼拔，自己降职成为副署长。
本萨姆接替离开深海大监狱的人妖王安布里奥·伊万科夫成为推进城5.5层新人妖乐园的新任女王。
瓦尔波被世界政府承认，成为邪恶暗黑磁鼓王国国王。
战国新任命为海军大督察。
斯摩格晋升为海军中将。
克比晋升为海军大佐。
草帽海贼团抵达新世界，登陆庞克哈萨德，遇到海军中将斯摩格和特拉法尔加·罗，打败了科学家凯撒·库朗，期间，蒙奇·D·路飞与罗组成海贼同盟准备挑战四皇百兽凯多。
罗路联盟为了破坏人造恶魔果实SMILE工厂登陆德雷斯罗萨王国，并打败了唐吉诃德·多弗朗明哥使得力库王族国王重回王位，同时路飞悬赏金涨到五亿贝里。
甚平为了让鱼人岛脱离四皇夏洛特·玲玲的庇护，加盟草帽海贼团，独自前往蛋糕岛，途中捡到了一块历史正文。
在德雷斯罗萨王国外海海域守护千里阳光号的文斯莫克·山治一行人遇到了BIG·MOM海贼团的攻击，被迫提前前往象岛佐乌。
已经是革命军参谋总长的萨博来到德雷斯罗萨王国，与多年未见的弟弟路飞相见。
德雷斯罗萨事件，唐吉诃德·多弗朗明哥败北，被海军抓进深海大监狱推进城关押。
黑胡子海贼团秘密偷袭革命军大本营，导致迪尔巴哥变成一片废墟。
因世界第一中介人唐吉诃德·多弗朗明哥被打败，所有受到解救的新世界强者们为了感谢草帽一伙的救命之恩，在德雷斯罗萨王国的外海海域，单方自愿加入草帽麾下成为小弟，饮下结义之酒，成立了“草帽大船团”。
草帽海贼团来到象岛佐乌，在这里找到了红色历史文本石碑并了解到其存在的意义，知道了毛皮族与光月家族世代友好的关系。
路飞结识和之国光月家族少主光月桃之助，为帮助和之国实现开国，在象岛佐乌决定与和之国武士，毛皮族结盟，讨伐四皇凯多。
巴兹尔·霍金斯、斯库拉奇曼·阿普、尤斯塔斯·基德三人组成海贼同盟准备挑战四皇红发香克斯，不料中途遭遇四皇百兽凯多，巴兹尔·霍金斯、斯库拉奇曼·阿普选择投靠，尤斯塔斯·基德反抗被抓。
蒙奇·D·路飞为营救文斯莫克·山治，登陆蛋糕岛，虽救出山治也激怒了四皇夏洛特·玲玲，同时路飞悬赏金涨到十五亿贝里，成为五皇。
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