当时，太尉黄琬、司徒杨彪、司空荀爽一同去见董卓。董卓又提出迁都的事，还说：“昔日高祖定都关中，历经十一代后汉室中兴，便迁都洛阳。从光武帝到现在，又历经十一代，按照《石苞室谶》的说法，应该再次迁都回长安。”众人听了，都惊愕得不敢出声。杨彪再次站出来反对：“迁都改制是天下大事，应当顺应民心，根据时势来决定。当年盘庚五次迁都，百姓都满心怨言，盘庚作了三篇文章才让大家明白。以前王莽篡逆，更改五常，更始帝和赤眉军时期，长安被焚烧，百姓惨遭杀害，流离失所，如今百不存一。光武帝顺应天命，迁都洛邑，这才是正确的选择。现在刚刚拥立圣主，想要光大汉室，却无缘无故舍弃宫庙、抛弃园陵，恐怕百姓会惊恐不安，无法理解，必定会引发骚乱。《石苞室谶》不过是妖邪之书，怎能轻信？”董卓恼羞成怒，喝道：“杨公是想阻挠国家大计吗？关东方乱，贼寇四起。崤山和函谷关地势险要，是国家的重要防线。而且从陇右获取木材，建造宫室也不难。杜陵南山下有汉武帝时期的陶窑旧址，制作砖瓦很快就能完成。建造宫室官府根本不是问题！百姓无知，不必与他们商议。要是有人敢反对，我就用大军驱赶，看他们还敢不敢不听话！”百官们听了，都吓得脸色惨白。黄琬赶紧劝道：“这可是大事，杨公的话，您不妨再仔细想想！”董卓却根本不听，当天就命令司隶校尉弹劾杨彪和黄琬，将他们二人免官。
随后，董卓便胁迫天子迁都长安。他还下令让自己的部队烧毁洛阳城方圆百里的地方，自己更是亲自带兵烧毁了南北宫、宗庙、府库以及百姓的房屋，洛阳城内被洗劫一空。他又将城中的富户们抓起来，随便给他们安个罪名，就没收他们的财物，许多无辜之人因此丧命，不计其数。
董卓对待俘虏的手段更是残忍至极。他抓到山东的士兵后，会用十几匹涂满猪油的布缠在他们身上，然后点火焚烧，从脚开始烧起。袁绍的豫州从事李延被他抓住后，更是被他下令煮杀。董卓有个宠爱的胡人，平日里仗着董卓的宠爱肆意妄为，被司隶校尉赵谦杀了。董卓得知后，暴跳如雷，怒吼道：“我心爱的狗，我都不许别人呵斥，更何况是人！”于是，他下令将司隶都官抓来，当场打死。
迁都长安后，董卓自封为太师，还想让别人尊称他为“尚父”。他询问蔡邕的意见，蔡邕委婉地说：“当年武王受天命，太公担任太师，辅佐周室讨伐无道之人，所以天下人尊称他为‘尚父’。如今您的功德确实巍巍然，不过最好还是等关东平定，天子东归之后，再商议此事。”董卓这才暂时打消了这个念头。后来，京师发生地震，董卓又向蔡邕询问原因。蔡邕回答说：“地动是因为阴气太盛，大臣超越了礼制所导致的。您乘坐青盖金华车，远近的人都觉得不合适。”董卓听后，这才换了金华皂盖车。
董卓得势后，他的弟弟董旻被封为左将军、鄠侯；哥哥的儿子董璜担任侍中、中军校尉，掌管兵权；董氏宗族内外的人都在朝廷中担任要职。董卓的侍妾怀中抱着的孩子，都被封侯，还赏赐给他们金印紫绶。他的孙女董白，还未到及笄之年，就被封为渭阳君。董卓在郿城东面筑起一座高坛，长宽各有两丈多，高五六尺。他让董白乘坐着轩金华青盖车，命令在郿的都尉、中郎将、刺史等二千石官员，都乘坐轩车，簪笔陪从，簇拥着董白来到高坛上，让董璜作为使者，为董白授予印绶。
公卿大臣们见到董卓，都要在他的车下参拜，可董卓却从不还礼。他还常常召呼尚书台以下的官员到自己的府上汇报事务。当年，董卓担任前将军，皇甫嵩担任左将军，两人一同征讨韩遂，互不相让。后来董卓被征召为少府、并州牧，他的军队本应归属皇甫嵩，董卓为此大怒。等到董卓成为太师，皇甫嵩担任御史中丞，皇甫嵩在董卓车前参拜。董卓得意地问：“义真，你现在服气了吗？”皇甫嵩回答：“我怎么会想到您能走到今天这一步！”董卓大笑道：“鸿鹄向来就有远大志向，只是燕雀自己不知道罢了。”皇甫嵩巧妙地回应：“过去我和您都像鸿鹄，没想到如今您变成了凤凰。”董卓听了，笑着说：“你要是早点服气，今天就不用拜了。”还有一次，董卓拍着手问皇甫嵩：“义真，你害怕了吗？”皇甫嵩回答：“您若能以德行辅佐朝廷，那是国家的福气，我有什么可害怕的？要是您滥用刑罚，肆意妄为，恐怕天下人都会害怕，又何止我一个呢？”董卓听了，沉默不语，之后便与皇甫嵩和解了。
为了给自己留条后路，董卓还在郿地修筑了一座坞堡，这座坞堡的高度和长安城一样，里面储存的粮食足够吃三十年。董卓曾大言不惭地说，要是他能成就大业，就雄踞天下；要是失败了，守着这座坞堡也能安度晚年。有一次，董卓前往郿坞，公卿大臣们都到横门外为他送行。董卓事先在那里设置了帐幔，大摆宴席。宴会上，他诱降了几百个北地的反叛者，当着众人的面，他残忍地先割掉这些人的舌头，接着有的被斩断手足，有的被挖去眼睛，还有的被丢进大锅里煮。那些人还没断气，就在桌子间翻滚惨叫，参加宴会的人都吓得浑身发抖，连手中的筷子都拿不住了，而董卓却像没事人一样，照常饮酒作乐。
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