就在赤眉军大乱的时候，冯异身先士卒，带领汉军就朝着十倍于自己的赤眉军反冲了过来， 赤眉军再也无力抵挡，紧接就在自相残杀中变成了溃逃，汉军顿时把赤眉军追的真真正正地开始丢盔卸甲，直到此时樊崇才意识到，即便没有祥瑞神鸟的加持，单论兵法战术，自己依然不是冯异的对手。
这一场大战下来，冯异奇迹般地俘虏了赤眉军八万余人，斩杀无数，而八万余人，这比冯异整个投入战场的全部兵力都要多，可谓打了个大大的胜仗。
在外围布防的刘秀得到这个消息，非常欣喜，立即下旨褒奖冯异和众将士，特别是对冯异先败后胜的战绩给出了极高的评价，并留下了“失之东隅，收之桑榆”的千古名句。
这一次赤眉军大伤元气之后，就开始被冯异追着打，赤眉军只能被动逃跑，跑着跑着，就跑到了宜阳，而在宜阳防守的，正是少年将军耿弇，耿弇正愁没地方打仗呢，赤眉军就送上门了，立刻开始狠揍赤眉军，刘秀布置在其他关口的将领得到消息也朝着宜阳汇聚，不久之后就彻底把赤眉军包围在了宜阳，直到此时，赤眉军终于彻底意识到，是真的回不去了。
赤眉军的小皇帝刘盆子让自己的哥哥去和刘秀请降，刘秀也没有把赤眉军彻底赶尽杀绝，就接受了刘盆子的投降，刘盆子在自己哥哥的暗中指导下，早就对献上印玺和绶带的礼仪烂熟于心，所以整个过程极为顺利，而刘秀也终于拿到了象征皇权正统的传国玉玺。
至此，横扫天下九年，让在华夏大地上留下无数枯骨坟茔的赤眉军被刘秀彻底荡平，天下再也看不到眉毛赤红的兵士了，而军中的重要将领，刘秀也没有斩杀，全部迁到洛阳，不仅给住宅还给了田地，意思就一个，你们也别折腾了，就在我的眼皮子底下好好过日子吧，而对于年仅十六岁的刘盆子，刘秀则予以厚待，虽然史书上再也不会出现他的名字，却因为他在投降的时候给足了大汉体面，刘秀就回报给他未来一生的富足安稳。
这其中唯一不甘心的就只有赤眉军最早的首领樊崇了，在不久之后又纠集同伴准备反叛，消息泄露之后，刘秀在失望之余就把他斩杀消亡了。
就在刘秀带着大军在宜阳解决赤眉军的时候，那个如瘟神一般的延岑趁着关中空虚，迅速占领了关中的大部分地区，然后把关中原本各自为战的势力全部收归麾下，一时间俨然一副关中之主的姿态，但是被延岑收归麾下的势力只是摄于延岑的难缠，表面上归附罢了，私底下依旧相互厮杀拼斗，这就给原本满目疮痍的关中大地带来了新一轮的浩劫。
刘秀在处理完赤眉军的事情之后，就继续命冯异携胜利之姿平定关中，别人都怕这个犹如瘟神一样的延岑，冯异却丝毫不惧，因为冯异军中可是有大汉的祥瑞神鸟坐镇，有这么一尊不着调的大神在，即便什么都不做，也会让汉军军威大盛。
不久之后，冯异就带着汉军在上林苑这个地方和延岑的大军接触上了，上林苑这个地方原本就是大汉孝武皇帝刘彻的宫苑，刘彻在这里培养出了完全效忠自己的亲兵羽林军，更是在最后把这支亲兵交给了大汉双壁之一的卫青，见证了一代军神的崛起。
此时汉军再来到这个尚武的地方，气势比出发之前更胜，发誓一定要在这个地方重振汉军威名，此时别说延岑不是瘟神，即便是瘟神亲临，面对汉军的勇猛都得退避三舍，一战下来，延岑被杀的大败，聚集的乌合之众统统被冯异全部降服，此时的投降就不再是表面上认怂，而是真真正正的认冯异为统领了，至此，关中终于在大乱好几年之后得以被汉军光复。
但是光复归光复，整个长安已经被各路军阀霍霍的不成样子了，粮食的价格都快飙升到金子一般了，普通百姓已经完全失去了存活的根本，冯异一见这样的情况，再次效仿从前刘秀在河北的做法，打击盗匪，恢复官署，重建秩序，然后从其他东边的城池不断调集粮食补给关中，终于在一番辛苦的治理之下，长安城终于缓过了这口气，开始渐渐有了生气，一时间冯异的威望达到了顶点，甚至私下有人称冯异为“关中王”，更有从前被冯异打败的人在刘秀面前进谗言，说冯异准备关闭关中门户，自立造反。
刘秀在听到这些构陷之词后，却是一笑了之，不仅没有对冯异丝毫怀疑，更是把冯异的一家老小全部送到长安，意思就一个，安安心心帮我经营关中重地，我还有别的事情要办。
解决掉赤眉军之后，刘秀大大松了一口气，这下子要办谁呢？自然就是之前来不及处理，在南阳胡闹的邓奉了。
延岑这个瘟神在离开关中之后，就跑到了南阳，还没有站稳脚跟，就再次被少年将军耿弇带着幽州突骑杀的大败 ，只能继续南逃，一直跑到荆州的南郡，这里有个自立为“楚黎王”的秦丰，延岑被秦丰接纳之后，才终于稳住败逃的势头，而延岑自己是南逃了，却把霉运留给了还在南阳纵横的邓奉。
邓奉本就和延岑已经勾搭上，眼下见延岑溃逃，也有点不怎么好的预感，毕竟延岑这个倒霉劲都快出名了，不过邓奉毕竟年轻，决定不信这个邪，继续奋力围困宛城，而也就是在这个时候，把守宛城的双星之一右将军万修积劳成疾，又因为城池被围困缺乏药物救治，最终没能等到南阳平定，带着遗憾陨落了。
消息传到刘秀手上，刘秀心痛之余大怒，带着平定关中的大军，开始亲自南下要和邓奉过过招了。
当邓奉得到刘秀已经亲自带兵朝自己而来的时候，终于意识到，延岑这个瘟神真的名不虚传，而已经夺下南阳大部分地盘的邓奉，也想和用兵如神的刘秀过过招，胜了就继续保卫南阳家乡，要是败了，那也说明刘秀的确是真命天子。
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