忆生盟历三百五十年冬，新芽计划首批学员的结业仪式在残损的思衡回廊举行。十二岁的林小星握着特制的「思辩笔」，笔尖划过空气便能凝结出思维具象化的光点，却在绘制象征「共存」的图案时，笔身突然发烫，光点扭曲成尖锐的棱角。与此同时，叶霜正在验收冰魄谷新改良的「明心铃」，铃舌震动时本该散发安抚心神的清音，此刻却传出令人牙酸的金属摩擦声，铃身浮现出细密的血纹。
江云澈在观星台的发现更令人心惊。他观测到的不仅是星象异动，那些代表不同文明的星辰间，竟出现了暗金色的「思想连接线」。当他试图用明心星图解析这些连线时，星图石板上渗出黑色黏液，黏液在地面蜿蜒成字：「平衡即牢笼，冲突生进化」。三人紧急在万象阁召开会议，却发现珍藏的上古典籍中，关于「多元宇宙思想战争」的记载正在自动褪色，取而代之的是陌生的符号，形似某种文明的侵略宣言。
「这些迹象表明，玄机子不过是冰山一角。」沈星河将布满裂痕的忆溯罗盘放在桌上，罗盘指针正不受控地指向北方——记忆花田深处的禁地。那里矗立着初代掌门们留下的「守心碑」，碑身曾记载着守护记忆的誓言，如今却被一层暗金色的雾气笼罩。当他们靠近时，碑身突然裂开，滚落出一卷散发着腐臭气息的羊皮卷，上面用血书写着：「当单一文明的思想触及宇宙边界，必将引发维度级别的清洗」。
探索过程中，叶霜的弟子意外触碰到禁地的禁制。刹那间，地面裂开无数缝隙，从中爬出由思想残渣凝聚的怪物。这些怪物形似扭曲的人形，皮肤表面流动着不同文明的文字与图案：有的刻着「弱肉强食」的宇宙法则，有的印着「万物归一」的宗教图腾。其中一只怪物张开布满齿轮的巨口，吐出的不是实体攻击，而是一段极具蛊惑性的思维波：「你们的包容，不过是对自身弱小的掩饰」。
江云澈立即展开明心星图构建防护屏障，却发现星图的力量在触及怪物的瞬间被吸收转化。关键时刻，林小星带着新芽计划的学员们赶到。孩子们手牵手，用未经雕琢的纯粹思维编织成光网。当光网笼罩怪物时，奇迹发生了——怪物身上的极端思想纹路开始崩解，显露出底下微弱的人性光芒。但更多的怪物从地底涌出，它们组成军团，高举着写有「消灭异己」「同化一切」的旗帜。
战斗正酣时，沈星河的忆溯罗盘突然剧烈震动，将他卷入一段跨越维度的记忆。他看到了宇宙诞生初期，不同文明因思想差异引发的惨烈战争：有的文明为追求绝对理性，将全体成员改造成机械生命；有的文明笃信混沌即真理，在星系间散播毁灭病毒。最终，这些极端文明都走向了自我毁灭，只留下飘荡在宇宙中的思想残骸，等待新的宿主。
「我们面对的不是某个敌人，而是整个宇宙的思维困境！」沈星河从记忆中挣脱，将见闻传递给同伴。叶霜当即决定回冰魄谷启动「冰心共鸣阵」，试图用情感共鸣的力量化解怪物的偏执；江云澈则操控明心星图，在星空中标记出所有思想连接线的节点，试图找到幕后黑手的源头。而沈星河带着学员们留守禁地，用忆溯罗盘构建「思维回收站」，将净化后的思想残渣转化为守护力量。
冰魄谷内，叶霜的冰心共鸣阵刚刚启动，便遭遇诡异反噬。阵法本应唤起共情，却让所有参与者陷入更深的自我怀疑。她在混乱中发现，阵眼处的冰心石被渗入了暗金色杂质。当她试图剔除杂质时，冰心石突然炸裂，释放出玄机子的残识虚影。「你们太天真了，」虚影狞笑着，「宇宙从来不是温床，而是思想的角斗场！」
与此同时，江云澈通过明心星图的追踪，发现所有思想连接线都汇聚向一个神秘的坐标——位于宇宙边缘的「暗熵星域」。那里被厚重的暗物质云层包裹，星图无法解析其中的任何信息。但在探查过程中，他截获了一段破碎的通讯：「第七文明已完成思想同化，开始清扫异见者...」
当沈星河在禁地建立起思维回收站时，意外发现了初代掌门玄机子的真正手记。原来，千年前他并非主动堕落，而是接触到了来自暗熵星域的思想污染。手记的最后一页，用血画着一个巨大的沙漏，上半部分装满了各种文明的思想结晶，下半部分则是浓稠的黑色液体，标注着「熵增终局」。
此时，忆生盟的警报突然响彻天际。无数暗金色的飞船从宇宙深处驶来，船身雕刻着与思想怪物相同的纹路。这些飞船并不发动实体攻击，而是向忆生盟投射「思维病毒」。修士们的识海纷纷出现混乱：有人坚信唯有毁灭所有文明才能终结冲突，有人开始崇拜起「绝对虚无」的理念。沈星河、叶霜和江云澈在通讯中断前达成共识：必须前往暗熵星域，找到这场思想瘟疫的源头。
在准备星舰的过程中，新芽计划的学员们发挥了关键作用。他们不受固有思维的限制，设计出「混沌共鸣引擎」——通过模拟思维碰撞产生的能量驱动飞船。当星舰冲破宇宙屏障，进入暗熵星域时，众人被眼前的景象震撼：这里漂浮着数以万计的文明残骸，每一块碎片都在诉说着不同的思想悲剧。而在星域核心，一座巨大的「思想熔炉」正在运转，熔炉中沸腾的不是岩浆，而是无数被扭曲的文明理念。
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